木瓜蛋白酶作為從木瓜未成熟果實中提取的天然酶類，最突出的優勢在于安全性。它屬于食品級酶制劑，已被納入國家食品安全標準允許使用的食品添加劑范疇，經過純化處理后無化學殘留，老人、兒童及敏感人群均可放心食用。相較于化學嫩肉劑可能導致的肉質發柴、營養流失問題，木瓜蛋白酶通過定向分解肉類中的膠原蛋白和彈性蛋白，在軟化纖維的同時，能最大程度保留肉汁與營養成分，讓嫩化后的肉類既松軟易嚼，又保持原有的鮮香口感。

木瓜蛋白酶在冷凍的情況下，也就是0-10度處理休眠的狀態，不會對肉起到嫩化作用，調味冷凍可以放比較久的時間，

木瓜蛋白酶嫩化牛肉是利用蛋白酶輕度水解蛋白質纖維達到嫩化的目地，因此，木瓜蛋白酶在腌制牛肉后，不立即烹飪會出現嫩化過度的情況，也就是我們常說的肉柴、肉綿。如何防止嫩化過度呢？有兩個解決方法：1添加量比建議添加量要放少一些；2添加木瓜蛋白酶腌制后，利用木瓜蛋白酶在0-10度低溫緩慢反應的特性，直接放冰箱保存。通過這兩個方法，可以有效的防止牛肉嫩化過度的現象。